Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms