Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2E1P29083 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2E1P29083 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms