Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX2P28328 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX2P28328 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX2P28328 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX2P28328 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX2P28328 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms