Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms