Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KDELR1P24390 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms