Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MYF6P23409 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MYF6P23409 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MYF6P23409 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms