Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALB2P22676 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CALB2P22676 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CALB2P22676 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CALB2P22676 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CALB2P22676 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CALB2P22676 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms