Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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CXCL3P19876 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CXCL3P19876 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CXCL3P19876 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CXCL3P19876 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CXCL3P19876 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CXCL3P19876 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CXCL3P19876 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CXCL3P19876 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CXCL3P19876 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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