Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF3P18847 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF3P18847 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF3P18847 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF3P18847 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms