Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ODC1P11926 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ODC1P11926 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms