Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNB1P11230 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms