Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM10L2BP0DMW5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM10L2BP0DMW5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms