Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLK3P07288 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms