Protein–RNA interactions for Protein: P06729

CD2, T-cell surface antigen CD2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2P06729 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD2P06729 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD2P06729 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD2P06729 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD2P06729 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD2P06729 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms