Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYF2O95926 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYF2O95926 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYF2O95926 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYF2O95926 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms