Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms