Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GGTLC3B5MD39 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms