Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CFAP73A6NFT4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms