Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB5A4FU69 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms