Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBE2J1Q9Y385 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2J1Q9Y385 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms