Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SORCS3Q9UPU3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms