Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF2Q9UNY4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms