Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DBF4Q9UBU7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms