Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms