Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REREQ9P2R6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms