Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms