Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms