Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP36Q9P275 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms