Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC180Q9P1Z9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms