Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM248Q9NWD8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms