Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms