Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP7BPQ9NSQ0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms