Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms