Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms