Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GFRA4Q9GZZ7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms