Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms