Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRXQ9BXM0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRXQ9BXM0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms