Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NICN1Q9BSH3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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