Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A9Q96Q91 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms