Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMTK3Q96Q04 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMTK3Q96Q04 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms