Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms