Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms