Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRIQ1Q96JM4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms