Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms