Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C18orf8Q96DM3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms