Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms