Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EME1Q96AY2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms