Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRIM63Q969Q1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRIM63Q969Q1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRIM63Q969Q1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRIM63Q969Q1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRIM63Q969Q1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRIM63Q969Q1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRIM63Q969Q1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM63Q969Q1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRIM63Q969Q1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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