Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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