Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF128Q8TEB7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms